4,715
Húsz évvel a történet kezdete előtt egy Föld felé tartó aszteroida elpusztítja a Plútót. A Plútó pusztulása miatt az aszteroida, amelyet Thanatosnak neveznek el, átmenetileg stagnál. Most, hogy elkerüljék a Föld közelgő pusztulását, a Nemzetközi Naprendszer-fejlesztési Ügynökség (ISDA) a "D-Projekt" keretében dolgozik, és létrehozza a "Dragonautot", miután egy sárkánytojást találnak az óceán mélyén. Ennek a fegyvernek az elsődleges célja az aszteroida megsemmisítése, amikor eljön az ideje. Azonban hamarosan rájönnek, hogy az aszteroida nem az egyetlen fenyegetésük, mivel hatalmas, sárkányszerű lények jelennek meg a Földön, amelyek pusztításra törekednek. Miután szemtanúja lesz az egyik lény által elkövetett gyilkosságnak, Jin Kamishina, egy magányos, 18 éves fiú, aki két évvel ezelőtt veszítette el családját egy űrsikló-balesetben, belekeveredik a sárkányok rejtélyeibe, és ő lesz a Dragonaut kiválasztott pilótája. Útján segítségére van Toa, egy titokzatos lány, aki megmenti őt attól, hogy halálba zuhanjon, miután a lény rátámad. Ahogy egyre mélyebben belemerülnek a sárkányok rejtélyeibe, új barátokra és ellenségekre lelnek, és közben egyre szorosabb kapcsolat alakul ki közöttük.