Aquarion Evol

12 000 évvel a Genesis Aquarion eseményei után az emberek a Vega csillagon élnek, ahol az elrablóknak nevezett transzdimenzionális lények állandó fenyegetése alatt. Ezek az ellenségek a Vega testvércsillagáról, az Altairról származnak, és a Vegán portyáznak az emberi életért. Ellenintézkedésként egy Neo-DEAVA nevű szervezet alakult az Elrablók elleni harcra. Aquaria nevű fejlett mecha ruhákat vezetnek, és szigorúan nemek szerint elkülönülnek. A fiúk és a lányok nem érintkezhetnek egymással; még attól is eltiltják őket, hogy ugyanazon a csatatéren harcoljanak. Az események azonban megdöbbentő fordulatot vesznek, amikor egy fejlett Abductor mecha ruha csatlakozik a harchoz. Két tinédzsert, Mikonót és Amatát belerángatják a konfliktusba. Amata tudtán kívül egy tabut követ el, amikor megidéz egy Aquariát, és elindítja a férfi és női Aquariák közötti úgynevezett Tiltott Egyesülést. A Neo-DEAVA megdöbben, és Amata tettének következményei sokkal messzebbre nyúlnak, mint azt Amata gondolná. Hogyan volt képes megidézni egy Aquariát? Hol tanulta meg, hogyan kell Tiltott Uniót alkotni? És miért volt képes Mikono is a mecha ruhát vezetni?