424
Az őszi szezon végéhez közeledve Chidori Yoshino, a Strega tagja elrabolja Junpei Iorit. Eközben Makoto Yuuki és a Specialized Extracurricular Execution Squad (SEES) megsemmisíti az Arcana Akasztott Embert. Nem sokkal később egy titokzatos playboy, Ryouji Mochizuki átiratkozik a Gekkoukan Gimnázium 2-F osztályába. A SEES tagjai állítólag elérték céljukat, és azt hiszik, hogy megszabadultak a harctól, amely könyörtelenül elrabolta szeretteik életét. És mégis, Tartarus és a Sötét Óra továbbra is létezik, és a tizenkettedik Árnyék kiirtása sem tántorítja el őket. A látszólagos kudarcuk miatt feldúlt SEES-nek meg kell birkóznia személyes küzdelmeivel, és rá kell jönnie, kinek az érdekében harcol. Ahogy Makoto és Junpei önfelfedező útja halad előre, Ryouji kiléte és az Aegis iránta érzett gyűlöletének oka is világossá válik.