5,431
Mikoto Misaka és barátai visszatértek, és pletykák után nyomoznak Academy Cityben. Hamarosan Mikoto rémületes dolgot fedez fel: szörnyű kísérletek zajlanak az egész városban, amelyek során több ezer esperest gyilkolnak meg. Ráadásul ezek az esperók korántsem hétköznapi emberek: ők magának Mikotónak a klónjai. Mikoto felelősnek érzi magát a velük való bánásmódért, ezért elindul, hogy véget vessen a kísérleteknek; az ellene álló erők azonban sokkal veszélyesebbek, mint gondolta, és Mikoto az elképzelhető legerősebb esperókkal találja magát szemben. A Toaru Kagaku no Railgun S folytatja a Railgun történetét, amint kétségbeesetten küzd azért, hogy véget vessen az embertelen kísérleteknek, amelyekhez szerinte ő is hozzájárult, és közben az élete mélyen a kétségbeesésbe sodródik. Academy Cityben sosincs unalmas pillanat, de senki sem mondta, hogy mindegyik kellemes lesz.